Validación e implementación de GeneXpert MTB/RIF para diagnóstico de tuberculosis en Ecuador
Resumen
El objetivo del estudio fue la validación e implementación de GeneXpert MTB/RIF para uso rutinario en la detección rápida de tuberculosis, y sensibilidad a la rifampicina en muestras clínicas; para esto se recogieron 1592 muestras respiratorias y fueron analizadas en el laboratorio del Instituto Nacional de Investigación en Salud Pública Guayaquil. El análisis de los resultados de GeneXpert en comparación con la baciloscopía mostraron una sensibilidad inicial de 99,8% y especificidad de 93,2%; el análisis de discrepancias utilizando los resultados del cultivo como método de referencia mostró que los resultados de GeneXpert considerados falsos negativos resultaron ser verdaderos negativos, lo mismo sucede con los falsos positivos que corresponden a verdaderos positivos. Recalculada la sensibilidad y especificidad del GeneXpert se tuvo 99,8% y 100% correspondientemente. La comparación con pruebas de sensibilidad a drogas mostró una sensibilidad de 91,4% y una especificidad del 95,5% para el sistema GeneXpert MTB/RIF. Se concluye que la implementación del sistema GeneXpert en Ecuador permitió dar solución a ciertos problemas asociados con la aplicación de las metodologías de diagnóstico convencionales, disminuyendo los tiempos de espera, e incrementando la sensibilidad y especificidad en el diagnóstico de la tuberculosis resistente a drogas, generando una oportunidad de diagnóstico tempranoCitas
Farga V, Camerino JA. Tuberculosis. 3ra ed. Buenos Aires: Editorial mediterraneo; 2011. 483 p.
World Health Organization. Global Tuberculosis Report 2016 [Internet]. World Health Organization. Ginebra: World Health Organization; 2016. Disponible en: http://www.who.int/tb/publications/global_report/en/
World Health Organization. Global Tuberculosis Report 2017 [Internet]. World Health Organization. Geneva; 2017 [citado 15 de enero de 2019]. Disponible en: https://extranet.who.int/tme
Herrera T, Arias F, Ruiz N, col. MANUAL OPERATIVO Implementación del GeneXpert MTB / RIF en el Programa de Tuberculosis [Internet]. Santiago de Chile: Ministerio de Salud. Gobierno de Chile; 2017 [citado 15 de enero de 2019]. 25 p. Disponible en: https://diprece.minsal.cl/wrdprss_minsal/wp-content/uploads/2018/02/2018.01.23_MANUAL-XPERT.pdf
Pantoja A, Fitzpatrick C, Vassall A, Weyer K, Floyd K. Xpert MTB/RIF for diagnosis of tuberculosis and drug-resistant tuberculosis: A cost and affordability analysis. Eur Respir J [Internet]. 2013;42(3):708-20. Disponible en: https://erj.ersjournals.com/content/42/3/708
Weyer K, Mirzayev F, Migliori GB, Van Gemert W, D’Ambrosio L, Zignol M, et al. Rapid molecular TB diagnosis: Evidence, policy making and global implementation of Xpert MTB/RIF. Eur Respir J [Internet]. 2013;42(1):252-71. Disponible en: https://erj.ersjournals.com/content/42/1/252
Uplekar M, Figueroa-Munoz J, Floyd K. The Stop TB Strategy: building on and enhancing DOTS to meet the TB-related Millennium Development Goals. [Internet]. WHO report. Geneva; 2006 [citado 15 de enero de 2019]. Disponible en: http://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/69241/WHO_HTM_STB_2006.368_eng.pdf;jsessionid=F3A55CF227C99794463DA5069B2E9048?sequence=1
World Health Organization. CONSEJO EJECUTIVO EB134/12 134.a reunión 29 de noviembre de 2013 Punto 6.1 del orden del día provisional [Internet]. Geneva; 2013 [citado 15 de enero de 2019]. Disponible en: http://apps.who.int/gb/ebwha/pdf_files/EB134/B134_12-sp.pdf?ua=1
Khan MS, Dar O, Sismanidis C, Shah K, Godfrey-Faussett P. Improvement of tuberculosis case detection and reduction of discrepancies between men and women by simple sputum-submission instructions: a pragmatic randomised controlled trial. Lancet [Internet]. 9 de junio de 2007;369(9577):1955-60. DOI: https://doi.org/10.1016/S0140-6736(07)60916-7
Organización Panamericana de la Salud. Manual para el diagnostico bacteriológico de la tuberculosis: Normas y Guía Técnica. Parte I Baciloscopía [Internet]. Washington, D.C; 2008 [citado 16 de enero de 2019]. Disponible en: http://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/166101/9789275330135.pdf?sequence=1&isAllowed=y
Organización Panamericana de la Salud. Manual para el diagnostico bacteriológico de la tuberculosis: Normas y Guía Técnica. Parte II Cultivo [Internet]. Washington DC; 2008 [citado 16 de enero de 2019]. Disponible en: http://iris.paho.org/xmlui/bitstream/handle/123456789/18616/tblabscultivo_2008.pdf?sequence=1&isAllowed=y
Nava O, Hassanhi M, Prieto L. Evaluación de la baciloscopia, cultivo y reacción en cadena de la polimerasa para el diagnóstico de tuberculosis pulmonar. Kasmera [Internet]. 2005 [citado 16 de enero de 2019];33(2):119-31. Disponible en: http://www.scielo.org.ve/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0075-52222005000200005
Vallejo P, Rodríguez J, Searle A, Farga V. Ensayo Xpert MTB/RIF en el diagnóstico de tuberculosis. Rev Chil enfermedades Respir [Internet]. 2015;31(2):127-31. Disponible en: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-73482015000200010&lng=en&nrm=iso&tlng=en
Rice JP, Seifert M, Moser KS, Rodwell TC. Performance of the Xpert MTB/RIF assay for the diagnosis of pulmonary tuberculosis and rifampin resistance in a low-incidence, high-resource setting. PLoS One [Internet]. 2017;12(10):1-15. DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0186139
Agapito J, Neyra V, Baldeviano C, Espinoza J, Accinelli R. Caracterización de las mutaciones en el gen rpoB asociadas a la resistencia a rifampicina y tipificación mediante RFLP (IS1610) en cepas de Mycobacterium Tuberculosis de pacientes con tuberculosis pulmonar. Enferm Torax [Internet]. 2003;46(1):9-24. Disponible en: http://sisbib.unmsm.edu.pe/bvrevistas/enfermedades_torax/v46_n1/caracte_muta.htm
Lee HY, Seong MW, Park SS, Hwang SS, Lee J, Park YS, et al. Diagnostic accuracy of Xpert® MTB/RIF on bronchoscopy specimens in patients with suspected pulmonary tuberculosis. Int J Tuberc Lung Dis [Internet]. 2013;17(7):917-21. Disponible en: http://www.ingentaconnect.com/content/10.5588/ijtld.12.0885
Zar HJ, Workman L, Isaacs W, Dheda K, Zemanay W, Nicol MP. Rapid diagnosis of pulmonary tuberculosis in African children in a primary care setting by use of Xpert MTB/RIF on respiratory specimens: A prospective study. Lancet Glob Heal [Internet]. 1 de agosto de 2013 [citado 16 de enero de 2019];1(2):e97-104. Disponible en: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25104164
Shrestha P, Khanal H, Dahal P, Dongol P. Programmatic Impact of Implementing GeneXpert MTB/RIF Assay for the Detection of Mycobacterium Tuberculosis in Respiratory Specimens from Pulmonary Tuberculosis Suspected Patients in Resource Limited Laboratory Settings of Eastern Nepal. Open Microbiol J [Internet]. 2018;12(1):9-17. Disponible en: http://benthamopen.com/FULLTEXT/TOMICROJ-12-9
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